Музей основан исследователем и реставратором северорусского деревянного зодчества А. В. Ополовниковым, который в 1951 году перевёз на Кижи дом Ошевнева из деревни Ошевнево на Большом Климецком острове.
По его проектам было отреставрировано около ста памятников деревянного зодчества, среди которых Кижский погост, Кемский собор и многие другие, а также основан Музей под открытым небом в Кижах.
Статус государственного учреждения музей получил в 1966 году.
В «Переписной и отказной книге крестьянских и бобыльских дворов Спасского Кижского погоста с деревнями и починками Олонецкого уезда» составленной стольником А. Б. Бренчаниновым и подьячим П. Курбатовым в 1696 году записано:
«… Погост Спасский в Кижах на Онего озере на Кижском острову, а на погосте строет церковь новую, теплую, клетцки, во имя Покрова Богородицы. Да в той же церкви построен предел во имя Николая Чудотворца, настоящая церковь Преображения Господне и прежняя Покрова Богородицы в прошлом 7202 году сгорели от молнии…»
На сегодня музей под открытым небом имеет 89 сооружений архитектуры, которые собрали со всей Карелии. Среди них есть один из самых древних деревянных храмов в России - это церковь Воскрешения Лазаря (XIV-XVI в.в).
В 1990 году ансамбль Кижского погоста был включен в Список всемирного культурного и природного наследия ЮНЕСКО. С 1993 года музей «Кижи» находится в Государственном своде особо ценных объектов культурного наследия народов Российской Федерации.
Использован материал: https://experience.tripster.ru/articles/kizhi/